​Sono 14 i capoluoghi di provincia dove gli elettori sono stati chiamati al ballottaggio per l'elezione dei sindaci oltre ai sei capoluoghi di Regione. Il Movimento 5 Stelle conquista per la prima volta due metropoli e trionfa a Roma e Torino. Il Pd perde la metà dei sindaci, ma tiene Milano, Bologna e Cagliari. Il centrodestra riprende quota a Trieste e conquista 10 sindaci nei comuni capoluogo di provincia. De Magistris si conferma sindaco di Napoli contro tutti. A Benevento rispunta Mastella, sostenuto dal centrodestra. Ai ballottaggi ha votato solo la metà degli aventi diritto (50,52% contro il 59,94% dei primo turno). Complessivamente (tra primo e secondo turno) le comunali 2016 nei comuni capoluogo di provincia assegnano 10 sindaci al centrodestra; 9 sindaci al centrosinistra; 3 sindaci al Movimento 5 Stelle; 3 sindaci alle liste civiche; 1 sindaco alla sinistra. Non mancano le novità: il ritorno di Clemente Mastella a Benevento, il sindaco 5stelle a Carbonia e il caso clamoroso di Varese, dove la Lega incassa la prima sconfitta dopo 23 anni.  BENEVENTO. Clemente Mastella è il sindaco con il 62,87% delle preferenze, mentre il candidato del centro sinistra Raffaele Del Vecchio si è fermato al 37,13%. Sono state scrutinate 70 sezioni su 72. BRINDISI. Carluccio Angela è sindaco con il 51,13% delle preferenze, mentre il candidato di centro sinistra Fernando Marino si è fermato al 48,87%. CARBONIA. Paola Massidda (M5s) è il nuovo sindaco con il 61,60% dei voti mentre Giuseppe Casti (Pd) ha ottenuto il 38,40%. CASERTA. Carlo Marino del centrosinistra è sindaco con il 62,74% mentre Riccardo Ventre si è fermato al 37,26%. CROTONE. Ugo Pugliese è il nuovo sindaco con il 59,27% mentre Rosanna Barbieri ha ottenuto il 40,73% dei voti. GROSSETO. Antonfrancesco Vivarelli Colonna (centrodestra) è sindaco con il 54,88%, mentre Lorenzo Mascagni (centrosinistra) ha preso il 45,12% delle preferenze. ISERNIA. Giacomo D'Apollonio è sindaco con il 59%, mentre Gabriele Melogli ha ottenuto il 41% delle preferenze. LATINA. Eletto Damiano Coletta con il 75,05%, mentre Nicola Calandrini ha ottenuto solo il 24,95% delle preferenze. NOVARA. Alessandro Canelli sostenuto da Lega Nord e centrodestra è il nuovo sindaco con il 57,77%, mentre lo sfidante di centrosinistra Andrea Ballarè ha preso il 42,23% dei voti. OLBIA. Settimo Nizzi è il nuovo sindaco con il 50,71% delle preferenze dopo un testa a testa che ha visto lo sfidante del centrosinistra Carlo Careddu ottenere il 49,29% dei voti. PORDENONE. Alessandro Ciriani è stato eletto sindaco con il 58,8%, mentre Daniela Giust si è fermata al 41,2%. RAVENNA. Il candidato di centrosinistra Michele De Pascale è sindaco con il 53,32% contro il 46,68% dello sfidante Massimiliano Alberghini. SAVONA. La candidata della Lega Ilaria Caprioglio è il nuovo sindaco con il 52,85% mentre la sfidante del centrosinistra Cristina Battaglia si è fermata al 47,15%. VARESE. Davide Galimberti del centrosinistra è il sindaco con il 51,8%; ha battuto il candidato del centrodestra Paolo Orrigoni che si è fermato al 48,2%.